在动画《琉璃神社下载》中，主人公八坂真尧突然找到了属于自己的一部神秘手机Ap ∷。这款所谓的“琉璃神社下载”可以将各种现实物品转化为数字形式进行下载，并且拥有许多超乎想象的功能。随着剧情逐渐展开，真尧不仅与其他玩家一起解决了一系列谜题，还意外卷入了隐藏在“琉璃神社下载”背后的深度阴谋之中。为了保护自己和同伴，真尧必须揭开事件背后的真相，并利用手上强大的技能绝地反击敌对势力。