《机密档案》是一部悬疑剧，讲述了特工李明被调查单位秘密派遣到一个神秘的小镇，解开日益增多的失踪案件之□□。他发现这个看似平静安宁的小镇背后隐藏着一个巨大的阴谋。在收集线索时，他结识了当地警察陈思和记者张婷，在三人联手追捕过程中逐渐揭开真相。最终，他们将危机救下，并公开了这个庞大阴谋网络。