《间谍教室》第二季，学生们在老师杀老鼠的计划下成功激发出了新能∵∴。与此同时，神秘组织威胁他们必须协助完成任务，否则暗杀他们的亲人。为了保护家人和揭露真相，学生成立严密策略展开行动，并参加全球间谍竞赛。在思想智慧和团队合作的引领下，他们解决精彩有趣的情节并逐渐拆解黑幕。在正义与阴谋之间前进的过程中培养他们成长，在全球目睹了他们阳光明媚又沉稳勇敢的侦察能力。