第二季《机动战士高达水星的魔女》故事发生在地球文字地带水星∵。一个新的恐怖组织崛起，试图摧毁和平。年轻的女性GNR-0017“魔女”成为了这个组织的关键目标。主角一行人为了保护她踏上旅程，面对迫在眉睫的危险与挑战。沃尔特中尉率领他们经历激烈战斗，在战斗中他们揭开了一个巨大阴谋，并且发现自己困于无法逃离水星这个死亡之星。剧情紧凑、扣人心弦，充满冲突和考验，也展现出友谊与爱情的力量。