《潜龙飞天2》故事发生在未来世界，人类面临危∴∴。主角扮演一名精英特工，被派往外太空的神秘星球调查异变现象。主角揭开这个星球背后隐藏的秘密，并意外发现了一个宇宙征服者组织的阴谋。为了挽救地球和人类命运，他与队友展开一场惊心动魄的战斗。紧张刺激的任务中，主角不断成长、探索自我，并最终成功破解对方阴谋，为地球带来和平和希望。